Archive for Aralık, 2006
PLOS
Diğer önemli bir veritabanı Public Library of Science (Plos), kendi içinde online dergiler içeriyor ki bunlar Biology, Genetics, Pathogens, Computational Biology, Clinical Trials ve Medicine. Bu dergilerin içerikleri üzerinde interaktif bir ortamda yorum ve tartışmaların yapılabilmesi amacıyla Plos One (beta) adında bir web sitesi kuruldu. Benzer olarak yayınlar üzerinde yorum yapılabilen diğer siteler Nature Blogs [...]
Filed under: Genetik veritabanları | Leave a Comment
NCBI
National Center for Biotechnology Information. Bu sayfa, ABD’nin en büyük tıp kitaplığı olan NLM’nin (National Library of Medicine) bir kolu olarak 1988’de Maryland’da kuruldu. Halen web’e dayalı en önemli biyolojik veritabanıdır. Bir çok genom dizilerini ve PubMed olarak bilinen biyomedikal ve biyoteknoloji ilişkili araştırma makalelerini kapsar. Bunun yanısıra Molecular Biology of the Cell, Genetics ve [...]
Filed under: Genetik veritabanları | Leave a Comment
Multiple Sequence Alignment (MSA) Biyoinformatikde DNA, RNA ve proteinlerin primer nükleotit dizileri arasındaki yapısal ve evrimsel benzerliklerin dikkate alınarak tanımlanması ve düzenlenmesidir. Nükleotit ve amino asit birimleri bir matriks boyunca sıraya dizilirler. Bu birimler arasında boşluklar bulunur, dolayısıyla dikey sıralar benzer dizi ve karakterleri temsil eder. Burada 2 diziden daha fazla DNA dizisi aynı anda [...]
Filed under: Computational Biology | Leave a Comment
Genetik tiplendirme
Bir canlının DNA düzeyinde tanımlanmasına genotyping denir. Genotyping yada “genetik tiplendirme” en fazla adli tıptaki kullanımıyla biliniyor. Suç mahalinden mikroskobik doku örnekleri toplanıp DNA testleri yapılır ve şüphelilerle karşılaştırılır. Bu testlerde insan DNA’sındaki gen-dışı bölgelerde bulunan “mikrosatelit” dizileri belirlenmektedir. Daha spesifik adı short-tandem-repeats – STRs- olan ve tekrar sayıları kişiden kişiye değişen bu diziler bir [...]
Filed under: Genotyping | Leave a Comment
